Skonto FC var en av fyra klubbar från Latvia som hade lag som spelade under Gothia Cup 2016. De deltog med ett lag i Gothia Tipselit Trophy (B17). Förutom Skonto FC spelade också 35 andra lag från 12 olika länder i Gothia Tipselit Trophy (B17). De var uppdelade i 6 olika grupper, varav Skonto FC började i Group 5 tillsammans med Örebro SK, Right to Dream and Djurgårdens IF. Skonto FC tog sig vidare till Play off A efter att ha hamnat på 1:a plats i Group 5. Därefter tog de sig till 1/4 Final, men förlorade den mot IF Elfsborg med 0-3. I finalen slog IF Elfsborg Helsingborgs IF och vann därmed hela Play off A i Gothia Tipselit Trophy (B17). Från området kring kommer också två andra klubbar (JDFS Alberts and SKF Latvija) som kommer att delta i Gothia Cup 2016.