Förutom Makati FC spelade också 162 andra lag från 30 olika länder i Boys 12. De var uppdelade i 40 olika grupper, varav Makati FC började i Group 4 tillsammans med IF Brommapojkarna, IFK Göteborg and Fc Franconville PB. Makati FC tog sig vidare till Play off B efter att ha hamnat på 4:e plats i Group 4. Därefter tog de sig till 1/32 Final, men förlorade den mot Markaryds IF med 0-4. I finalen slog Olympiacos FC Chungmu och vann därmed hela Play off B i Boys 12. Makati FC deltog även i Boys 11 under Gothia Cup 2013. Då tog de sig till 1/16 Final i Play off B, men förlorade den mot AV 84 med 0-4.