Förutom Makati FC spelade också 120 andra lag från 26 olika länder i Boys 11. De var uppdelade i 30 olika grupper, varav Makati FC började i Group 3 tillsammans med IFK Göteborg 1, TSV Buchholz 08 1 and Boo FF. Makati FC tog sig vidare till Play off B efter att ha hamnat på 4:e plats i Group 3. Därefter tog de sig till 1/8 Final, men förlorade den mot Backatorp IF med 2-5. I finalen slog Assyriska BK IF Brommapojkarna 1 och vann därmed hela Play off B i Boys 11. Makati FC deltog även i Boys 11 under Gothia Cup 2013. Då tog de sig till 1/16 Final i Play off B, men förlorade den mot AV 84 med 0-4.