Förutom de två Häcken-lagen spelade också 161 andra lag från 31 olika länder i Boys 12. De var uppdelade i 40 olika grupper, varav BK Häcken 2 började i Group 32 tillsammans med KF Gjakova, Västerås IK 2 and Süderneulander SV. BK Häcken 2 tog sig vidare till Play off B efter att ha hamnat på 4:e plats i Group 32. Därefter tog de sig till 1/32 Final, men förlorade den mot Olympiacos FC med 1-3. I finalen slog Olympiacos FC Chungmu och vann därmed hela Play off B i Boys 12. BK Häcken deltog även i Boys 11 under Gothia Cup 2013. Då tog de sig till 1/16 Final i Play off A, men förlorade den mot Helsingborgs IF 1 med 1-5.