Förutom Ekerö IK spelade också 134 andra lag från 27 olika länder i Boys 18. De var uppdelade i 33 olika grupper, varav Ekerö IK började i Group 15 tillsammans med InterClubes, Jain IS and Stenungsunds IF. Ekerö IK tog sig vidare till Play off A efter att ha hamnat på 1:a plats i Group 15. Därefter tog de sig till 1/32 Final, men förlorade den mot Göteborgs FF med 1-2. I finalen slog Kampala Junior Team GAIS och vann därmed hela Play off A i Boys 18. Ekerö IK deltog även i Boys 18 under Gothia Cup 2012. Då tog de sig till 1/16 Final i Slutspel B, men förlorade den mot Onsala BK med 1-2.