Förutom JSSL Arsenal Singapore spelade också 176 andra lag från 29 olika länder i Boys 16. De var uppdelade i 44 olika grupper, varav JSSL Arsenal Singapore började i Group 30 tillsammans med Horred IF, Mexico F.C and Eskilstuna City FK 1. JSSL Arsenal Singapore tog sig vidare till Play off B efter att ha hamnat på 3:e plats i Group 30. Därefter tog de sig till 1/16 Final, men förlorade den mot EARJ med 1-4. I finalen slog Skiljebo SK Seatown FC och vann därmed hela Play off B i Boys 16. JSSL Arsenal Singapore deltog även i Boys 15 under Gothia Cup 2012. Då tog de sig till 1/32 Final i Slutspel B, men förlorade den mot TSV Bassum eV med 1-2.