Förutom FC St. Pauli Hamburg spelade också 76 andra lag från 13 olika länder i Girls 17. De var uppdelade i 19 olika grupper, varav FC St. Pauli Hamburg började i Group 15 tillsammans med SK Djerv 1919, Tuve IF and Skattkärrs IF. FC St. Pauli Hamburg tog sig vidare till Play off B efter att ha hamnat på 4:e plats i Group 15. Därefter tog de sig till 1/32 Final, men förlorade den mot Varhaug med 1-2. I finalen slog Ranrike ALS Lillån FK och vann därmed hela Play off B i Girls 17. FC St. Pauli Hamburg deltog även i Girls 17 under Gothia Cup 2012. Då tog de sig till 1/32 Final i Slutspel B, men förlorade den mot ISA Italia med 0-5.